Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG2BQ96BY7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms