Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms