Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HGDQ93099 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HGDQ93099 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HGDQ93099 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HGDQ93099 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HGDQ93099 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HGDQ93099 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HGDQ93099 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HGDQ93099 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HGDQ93099 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms