Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms