Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF1Q92879 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF1Q92879 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms