Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRQ92752 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRQ92752 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRQ92752 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRQ92752 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRQ92752 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRQ92752 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRQ92752 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRQ92752 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRQ92752 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRQ92752 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRQ92752 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRQ92752 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRQ92752 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRQ92752 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRQ92752 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRQ92752 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRQ92752 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRQ92752 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRQ92752 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRQ92752 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRQ92752 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRQ92752 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRQ92752 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRQ92752 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRQ92752 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRQ92752 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRQ92752 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRQ92752 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRQ92752 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRQ92752 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNRQ92752 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNRQ92752 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNRQ92752 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TNRQ92752 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms