Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms