Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms