Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC4Q8TBB5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms