Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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