Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBI5

SLC43A3, Solute carrier family 43 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3Q8NBI5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A3Q8NBI5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A3Q8NBI5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms