Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms