Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2BQ8N4Y2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRACR2BQ8N4Y2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms