Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms