Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms