Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf47Q6ZRZ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf47Q6ZRZ4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf47Q6ZRZ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf47Q6ZRZ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf47Q6ZRZ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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C9orf47Q6ZRZ4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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