Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms