Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR2Q6VAB6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR2Q6VAB6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms