Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms