Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RWDD4Q6NW29 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RWDD4Q6NW29 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms