Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms