Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms