Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms