Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms