Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms