Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL8

PDZD11, PDZ domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD11Q5EBL8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms