Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms