Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms