Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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