Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms