Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms