Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR1Q2NL82 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms