Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms