Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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GEN1Q17RS7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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