Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME3Q16798 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ME3Q16798 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME3Q16798 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME3Q16798 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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