Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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