Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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