Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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