Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
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