Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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