Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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