Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KARSQ15046 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KARSQ15046 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KARSQ15046 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KARSQ15046 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KARSQ15046 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KARSQ15046 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KARSQ15046 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms