Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLCA4Q14CN2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms