Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
GAPVD1Q14C86 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GAPVD1Q14C86 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
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