Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDC1Q14676 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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