Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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