Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT1Q14517 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT1Q14517 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT1Q14517 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT1Q14517 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT1Q14517 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT1Q14517 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT1Q14517 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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FAT1Q14517 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT1Q14517 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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