Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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