Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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