Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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COL4A6Q14031 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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COL4A6Q14031 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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COL4A6Q14031 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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